營養繁殖時，藻體斷裂形成新藻體。無性生殖是形成頂端有4條鞭毛的游動孢子，有性生殖為同配或者異配。單細胞藻類個頭小，表面積大，所以吸收養分快，又因為它們很容易死亡或被動物吃掉，所以一旦有合適的條件，它們就會以驚人的速度不停地繁殖、繁殖、繁殖。大量繁殖的藻華生物不僅會堵塞魚類等呼吸生物，致其死亡，而且會遮蔽射入水體的陽光，使固著在水底的其他藻類因缺少陽光而死去；有的藻華生物還會釋放毒素，并在魚和貝類中積累，水鳥或人類在攝食這些魚和貝類之后便會中毒；藻華生物本身死亡之后還會腐爛分解，從而大量消耗水中的氧氣，從而徹底讓它爆發的水域成為“死水一潭”。
鄂爾多斯滸苔則不然，正因為它是多細胞生物，它的繁殖速度比單細胞的藻華生物要慢，因此鄂爾多斯滸苔爆發是很少發生的，往往還沒輪到它瘋長，有害藻華就先行發生了。但是，鄂爾多斯滸苔有一種本領，可以分泌一些特殊的化學物質，阻止藻華生物的繁殖，所以在碰巧的情況下，鄂爾多斯滸苔也可以先于藻華生物爆發——2008年夏天的青島海邊，就出現了這種情況
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